{"id":4081,"date":"2021-07-07T14:49:49","date_gmt":"2021-07-07T18:49:49","guid":{"rendered":"https:\/\/outbreaktools.ca\/?page_id=4081"},"modified":"2026-04-22T15:02:16","modified_gmt":"2026-04-22T19:02:16","slug":"cluster-code","status":"publish","type":"page","link":"https:\/\/outbreaktools.ca\/fr\/case-study-overview\/module-1-cluster-detection-and-initial-investigation-2\/cluster-code\/","title":{"rendered":"Codes de grappe"},"content":{"rendered":"

Jour\u00a07\u00a0: Jeudi\u00a014 mai\u00a02020<\/strong><\/p>\n

Lorsque des grappes de maladies ent\u00e9riques sont d\u00e9tect\u00e9es, que ce soit dans une seule province ou un seul territoire ou dans plusieurs provinces ou territoires, les \u00e9pid\u00e9miologistes d\u2019administrations f\u00e9d\u00e9rales travaillant pour l\u2019Agence de la sant\u00e9 publique du Canada (ASPC)<\/a> sont avis\u00e9s par PulseNet Canada \u00e0 travers le R\u00e9seau des laboratoires de surveillance du Canada (RLSC)<\/a>. PulseNet Canada d\u00e9tecte les grappes d\u2019infection \u00e0 Salmonella<\/em> \u00e0 l\u2019aide des crit\u00e8res suivants\u00a0: deux isolats ou plus ayant de 0 \u00e0 10 diff\u00e9rences d\u2019all\u00e8les selon l\u2019analyse wgMLST. Lorsqu\u2019une grappe d\u2019infection \u00e0 Salmonella<\/em> est d\u00e9tect\u00e9e selon ce crit\u00e8re, un code de grappe lui est attribu\u00e9. De plus amples renseignements sur le SGE et les diff\u00e9rences entre les all\u00e8les dans un contexte d\u2019\u00e9closion sont disponibles ici<\/a>.<\/p>\n

En examinant les rapports hebdomadaires de PulseNet Canada sur le SGE des grappes affich\u00e9s sur le RLSC, vous remarquez que le rapport Salmonella<\/em> comprend une nouvelle grappe de cinq isolats de Salmonella<\/em> Newport en Ontario apparent\u00e9s par SGE. Cette grappe a re\u00e7u le code suivant\u00a0: 2005NEWWGS-1ON.<\/p>\n

Les codes de grappe respectent une structure normalis\u00e9e d\u00e9crite ci-dessous.<\/p>\n

\"Description<\/a>
Description : Diagramme illustrant la structure d\u2019un code de grappe. Le code de grappe est 2005NEWWGS-1ON. Voici la structure du code : 20 (ann\u00e9e); 05 (mois); NEW (agent pathog\u00e8ne : Salmonella Newport); WGS (identifi\u00e9 au moyen du s\u00e9quen\u00e7age du g\u00e9nome entier) -1ON (premi\u00e8re grappe d\u2019agents pathog\u00e8nes signal\u00e9e en Ontario en mois\/ann\u00e9e).<\/figcaption><\/figure>\n

Les deux premiers chiffres d\u2019un code de grappe repr\u00e9sentent l\u2019ann\u00e9e o\u00f9 la grappe a \u00e9t\u00e9 d\u00e9tect\u00e9e pour la premi\u00e8re fois (p. ex. 2020). Les deux chiffres suivants repr\u00e9sentent le mois o\u00f9 la grappe a \u00e9t\u00e9 d\u00e9tect\u00e9e pour la premi\u00e8re fois (p. ex. mai, repr\u00e9sent\u00e9 par 05). Les lettres suivantes en orange fournissent des renseignements sur l\u2019agent pathog\u00e8ne et le s\u00e9rotype (p. ex. Salmonella<\/em> Newport). Les caract\u00e8res qui suivent le tiret indiquent si la grappe est d\u00e9tect\u00e9e dans une seule administration (associ\u00e9e \u00e0 une seule province ou \u00e0 un seul territoire) ou dans plusieurs administrations (associ\u00e9e \u00e0 plusieurs provinces ou territoires). Si une grappe comprend des isolats provenant de plusieurs provinces ou territoires, on lui attribue la d\u00e9signation MP, qui signifie \u00ab\u00a0multiples provinces\u00a0\u00bb. Si une grappe est d\u00e9tect\u00e9e dans une seule province ou un seul territoire, on lui attribue une d\u00e9signation pour repr\u00e9senter cette administration (p. ex. ON pour Ontario).<\/p>\n

\u00c9tant donn\u00e9 que la grappe n\u2019appara\u00eet que dans une seule administration, vous savez que PulseNet Canada n\u2019a d\u00e9tect\u00e9 aucune correspondance \u00e0 l\u2019ext\u00e9rieur de l\u2019Ontario. Sachant que tous les cas se trouvent actuellement dans une seule province, l\u2019Ontario continuera de diriger l\u2019enqu\u00eate sur ces cas.<\/p>\n

Vous d\u00e9cidez de continuer la surveillance de cette grappe pour voir si de nouveaux isolats provenant d\u2019une autre province ou d\u2019un autre territoire y seront ajout\u00e9s au cours des prochaines semaines.<\/p>\n

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