{"id":4170,"date":"2021-07-08T11:48:46","date_gmt":"2021-07-08T15:48:46","guid":{"rendered":"https:\/\/outbreaktools.ca\/?page_id=4170"},"modified":"2025-02-03T10:55:31","modified_gmt":"2025-02-03T14:55:31","slug":"exercise-2","status":"publish","type":"page","link":"https:\/\/outbreaktools.ca\/fr\/case-study-overview\/module-2-hypothesis-generation-2\/exercise-2\/","title":{"rendered":"Exercice 2 : Analyse de la consommation alimentaire dans Excel"},"content":{"rendered":"<p><strong>\u00a0Jour\u00a022\u00a0: Vendredi 29 mai\u00a02020 (n<\/strong>\u00a0<strong>=<\/strong>\u00a0<strong>14)<\/strong><\/p>\n<p>Jusqu\u2019\u00e0 ce matin, vous avez effectu\u00e9 sept nouvelles entrevues au moyen du questionnaire g\u00e9n\u00e9rateur d\u2019hypoth\u00e8ses.<\/p>\n<p>Vous d\u00e9cidez d\u2019entrer vos questionnaires dans une base de donn\u00e9es puis d\u2019exporter les donn\u00e9es dans Microsoft Excel pour en faire l\u2019analyse. Vous devez analyser les donn\u00e9es pour d\u00e9terminer la fr\u00e9quence des expositions des cas et d\u00e9terminer si certaines expositions sont d\u00e9clar\u00e9es \u00e0 des fr\u00e9quences anormalement \u00e9lev\u00e9es, comparativement aux donn\u00e9es de base de la population.<\/p>\n<p>Des \u00e9tudes ax\u00e9es sur la population, comme l\u2019\u00e9tude <a href=\"https:\/\/www.canada.ca\/fr\/sante-publique\/services\/publications\/aliments-et-nutrition\/rapport-foodbook.html\">Foodbook<\/a> et l\u2019<a href=\"https:\/\/www.cdc.gov\/foodnet\/surveys\/population.html\">enqu\u00eate sur la population FoodNet du CDC<\/a>, fournissent aux enqu\u00eateurs des donn\u00e9es de r\u00e9f\u00e9rence sur la fr\u00e9quence \u00e0 laquelle des personnes non malades ont \u00e9t\u00e9 expos\u00e9es \u00e0 certains aliments sur une p\u00e9riode de 7 jours. Ces donn\u00e9es peuvent servir de point de comparaison pour les donn\u00e9es du questionnaire afin de d\u00e9terminer les expositions alimentaires que les cas de l\u2019\u00e9closion ont signal\u00e9es plus souvent que pr\u00e9vu.<\/p>\n<p>Pour en savoir plus sur la fr\u00e9quence de consommation pr\u00e9vue, consultez les documents de lecture pr\u00e9alable ci\u2011dessous.<\/p>\n<p><strong>Lecture pr\u00e9alable<\/strong><\/p>\n<ul>\n<li><a href=\"https:\/\/outilspoureclosions.ca\/background\/data-management\/\">Gestion des donn\u00e9es<\/a><\/li>\n<li><a href=\"https:\/\/outilspoureclosions.ca\/background\/hypothesis-generation\/#exposure\">Analyse de l\u2019exposition<\/a> (fait partie de la section <a href=\"https:\/\/outilspoureclosions.ca\/background\/hypothesis-generation\/\">G\u00e9n\u00e9ration d\u2019hypoth\u00e8ses<\/a>)<\/li>\n<\/ul>\n<p><strong>\u00a0<\/strong>Cet exercice se divise en trois parties.<\/p>\n<p><strong>Partie\u00a01<\/strong><\/p>\n<p><strong>\u00a0<\/strong>Examinez les donn\u00e9es initiales sur l\u2019exposition alimentaire dans le tableau\u00a01 (\u00ab\u00a0donn\u00e9es originales\u00a0\u00bb) du module\u00a02 \u2013 Exercice\u00a02.<\/p>\n<p>D\u00e9terminez les expositions alimentaires qui ont le plus de points communs parmi les cas \u2013 examinez la proportion de cas ayant r\u00e9pondu \u00ab\u00a0Oui\u00a0\u00bb, ainsi que ceux ayant r\u00e9pondu \u00ab\u00a0Oui\u00a0\u00bb ou \u00ab\u00a0Probablement\u00a0\u00bb.<\/p>\n<p>Calculez la proportion de cas d\u00e9clarant chaque aliment ([Oui+Probablement]\/[Oui+Probablement+Non]]. Remarquez que les r\u00e9ponses \u00ab\u00a0Ne sait pas\u00a0\u00bb ne sont pas incluses dans l\u2019analyse des fr\u00e9quences de consommation. En pratique, les enqu\u00eateurs examinent toutes les expositions, quel que soit le nombre de cas qui les d\u00e9clarent. Cela s\u2019explique par le fait que tous les cas n\u2019auront pas n\u00e9cessairement \u00e9t\u00e9 interrog\u00e9s sur toutes les expositions. De plus, certains aliments (p. ex. pousses, noix, graines, farine) peuvent \u00eatre les ingr\u00e9dients d\u2019autres aliments ou servir de garniture, de sorte qu\u2019il sera plus difficile de s\u2019en souvenir. M\u00eame une faible proportion de cas d\u00e9clarant un aliment peu commun ou un aliment susceptible d\u2019\u00eatre utilis\u00e9 comme un ingr\u00e9dient peut fournir un indice important aux enqu\u00eateurs pendant la g\u00e9n\u00e9ration d\u2019hypoth\u00e8ses. Les enqu\u00eateurs examineront \u00e9galement de pr\u00e8s les expositions qui \u00ab\u00a0se d\u00e9marquent\u00a0\u00bb, car elles sont d\u00e9clar\u00e9es plus fr\u00e9quemment que ce \u00e0 quoi on pourrait s\u2019attendre d\u2019apr\u00e8s les donn\u00e9es d\u00e9mographiques (\u00e0 <em>p<\/em>\u00a0<\u00a00,05) ainsi que les expositions qui sont d\u00e9clar\u00e9es fr\u00e9quemment, sans pour autant se d\u00e9marquer.<\/p>\n<p><strong>Partie\u00a02<\/strong><\/p>\n<p><strong>\u00a0<\/strong>Comparez les fr\u00e9quences de consommation \u00e0 celles de r\u00e9f\u00e9rence dans le tableau\u00a02 (\u00ab\u00a0Fr\u00e9quence de consommation de r\u00e9f\u00e9rence\u00a0\u00bb) du <a href=\"https:\/\/outilspoureclosions.ca\/case-study\/module-2-hypothesis-generation\/exercise-2\/exercise-2-tables\/\">module\u00a02 \u2013 Exercice\u00a02<\/a>.<\/p>\n<p>Comment la proportion de cas d\u00e9clarant une exposition se compare-t-elle aux niveaux pr\u00e9vus (p. ex. proportions obtenues \u00e0 partir des donn\u00e9es d\u2019enqu\u00eates alimentaires effectu\u00e9es sur la population)?<\/p>\n<input type='hidden' bg_collapse_expand='69e8fbd87b8324061355712' value='69e8fbd87b8324061355712'><input type='hidden' id='bg-show-more-text-69e8fbd87b8324061355712' value='R\u00e9ponse '><input type='hidden' id='bg-show-less-text-69e8fbd87b8324061355712' value='Montrer moins'><button id='bg-showmore-action-69e8fbd87b8324061355712' class='bg-showmore-plg-button bg-blue-button bg-arrow '   style=\" color:#fffff;\">R\u00e9ponse <\/button><div id='bg-showmore-hidden-69e8fbd87b8324061355712' >\n<p>Certains aliments (p. ex. les \u0153ufs, les concombres, les poivrons, les pommes, les bananes) se situent \u00e0 moins de 10\u00a0% des niveaux pr\u00e9vus, ce qui sugg\u00e8re qu\u2019ils pourraient ne pas pr\u00e9senter un int\u00e9r\u00eat suppl\u00e9mentaire. Toutefois, il est important de toujours calculer la probabilit\u00e9 binomiale pour ces aliments avant de les exclure.<\/p>\n<p><strong>Les aliments suivants n\u2019\u00e9taient pas disponibles dans l\u2019enqu\u00eate alimentaire\u00a0:<\/strong><\/p>\n<ul>\n<li>Graines de chia<\/li>\n<li>Graines de lin<\/li>\n<li>Autres graines<\/li>\n<li>Succ\u00e9dan\u00e9s du lait<\/li>\n<li>Pistaches<\/li>\n<li>Autres noix<\/li>\n<\/ul>\n<p>L\u2019utilisation de la fr\u00e9quence de consommation pr\u00e9vue comporte de nombreuses limitations, par exemple, elle ne tient pas compte des variables suivantes\u00a0:<\/p>\n<ul>\n<li>La saisonnalit\u00e9 (p. ex. la consommation de cerises est plus \u00e9lev\u00e9e en \u00e9t\u00e9; toutefois, les niveaux pr\u00e9vus sont fond\u00e9s sur la moyenne de l\u2019ensemble de l\u2019ann\u00e9e et ne tiennent donc pas compte des variations par mois);<\/li>\n<li>Les diff\u00e9rences de consommation entre les hommes et les femmes, ou diff\u00e9rents groupes d\u2019\u00e2ge, l\u2019emplacement g\u00e9ographique;<\/li>\n<li>Les divers r\u00e9gimes alimentaires ethniques, religieux ou culturels <\/div><\/li>\n<\/ul>\n<p><strong>Question 2-8 : Comment pourriez-vous utiliser les donn\u00e9es de Foodbook pour g\u00e9rer ces limitations (par exemple, si les cas se trouvent uniquement dans les provinces de l\u2019Atlantique et sont principalement \u00e2g\u00e9s de moins de 18 ans)?<\/strong><\/p>\n<input type='hidden' bg_collapse_expand='69e8fbd87ba443097201050' value='69e8fbd87ba443097201050'><input type='hidden' id='bg-show-more-text-69e8fbd87ba443097201050' value='R\u00e9ponse '><input type='hidden' id='bg-show-less-text-69e8fbd87ba443097201050' value='Montrer moins'><button id='bg-showmore-action-69e8fbd87ba443097201050' class='bg-showmore-plg-button bg-blue-button bg-arrow '   style=\" color:#fffff;\">R\u00e9ponse <\/button><div id='bg-showmore-hidden-69e8fbd87ba443097201050' ><\/p>\n<p><strong>\u00a0<\/strong>Dans ces situations, vous pouvez restreindre les donn\u00e9es de Foodbook afin de mieux refl\u00e9ter la population des cas.<\/p>\n<p>Pour vous aider \u00e0 r\u00e9gler certaines de ces limitations, vous pouvez restreindre la fr\u00e9quence de consommation pr\u00e9vue pour qu\u2019elle s\u2019harmonise mieux avec vos cas. Par exemple, si vous avez une \u00e9closion dans laquelle les cas sont principalement des enfants de moins de 18 ans, vous pouvez examiner la valeur de Foodbook pour le groupe d\u2019\u00e2ge des 0 \u00e0 18 ans. Pour tenir compte de certains aliments plus saisonniers (p. ex. baies fra\u00eeches, melon d\u2019eau, cerises, etc.), il peut \u00eatre utile d\u2019utiliser les valeurs de Foodbook pour la p\u00e9riode correspondant aux dates d\u2019apparition des sympt\u00f4mes chez vos cas (p. ex. si vos cas ont commenc\u00e9 \u00e0 \u00eatre malades du 15 juillet au 25 ao\u00fbt, examinez les valeurs de Foodbook recueillies en juillet et en ao\u00fbt seulement). Si vos cas ne se trouvent que dans quelques provinces ou territoires d\u2019une certaine r\u00e9gion du pays (p. ex. l\u2019est du Canada, l\u2019ouest du Canada, le nord du Canada), examinez les valeurs de Foodbook pour ces provinces ou territoires seulement.<\/p>\n<p>L\u2019ensemble complet des donn\u00e9es de Foodbook est accessible <a href=\"https:\/\/ouvert.canada.ca\/data\/fr\/dataset\/ddf6c129-2698-422a-abb5-f7465ed549ee\">ici<\/a> et peut \u00eatre utilis\u00e9 \u00e0 de telles fins.<\/p>\n<p><strong>\u00a0<\/strong>Un autre d\u00e9fi se pose lorsque les cas ont des habitudes de consommation similaires. Parfois, si des cas mangent plusieurs des m\u00eames aliments, il devient difficile de d\u00e9terminer une source suspecte. Par exemple, cette population particuli\u00e8re de cas semble consommer en grande partie des aliments \u00e0 base v\u00e9g\u00e9tale. Ils consomment donc tous beaucoup de fruits et l\u00e9gumes frais de tous genres, des baies, l\u00e9gumes-feuilles et autres l\u00e9gumes. <\/div>\n<p><strong>\u00a0<\/strong><strong>Partie\u00a03<\/strong><\/p>\n<p>Le calcul de la probabilit\u00e9 binomiale est une fa\u00e7on de d\u00e9terminer si la diff\u00e9rence entre les proportions de cas d\u00e9clarant une exposition est significativement diff\u00e9rente de la proportion \u00e0 laquelle on s\u2019attend.<\/p>\n<p>Examinez le tableau\u00a03 (\u00ab\u00a0Probabilit\u00e9 binomiale\u00a0\u00bb) du <a href=\"https:\/\/outilspoureclosions.ca\/case-study\/module-2-hypothesis-generation\/exercise-2\/exercise-2-tables\/\">module\u00a02 \u2013 Exercice\u00a02.<\/a> Quels produits alimentaires sont d\u00e9clar\u00e9s \u00e0 une fr\u00e9quence beaucoup plus \u00e9lev\u00e9e que celle \u00e0 laquelle on s\u2019attend?<\/p>\n<input type='hidden' bg_collapse_expand='69e8fbd87bb984098490958' value='69e8fbd87bb984098490958'><input type='hidden' id='bg-show-more-text-69e8fbd87bb984098490958' value='R\u00e9ponse '><input type='hidden' id='bg-show-less-text-69e8fbd87bb984098490958' value='Montrer moins '><button id='bg-showmore-action-69e8fbd87bb984098490958' class='bg-showmore-plg-button bg-blue-button bg-arrow '   style=\" color:#fffff;\">R\u00e9ponse <\/button><div id='bg-showmore-hidden-69e8fbd87bb984098490958' >\n<p>Les aliments suivants sont consid\u00e9r\u00e9s comme pr\u00e9sentant un int\u00e9r\u00eat significatif \u00e0 <em>p\u00a0<\/em>\u2264\u00a00,05.<\/p>\n<ul>\n<li><strong>L\u00c9GUMES\u00a0:<\/strong> \u00e9pinards, pousses et courgettes<\/li>\n<li><strong>FRUITS\u00a0:<\/strong> bleuets, m\u00fbres, mangues<\/li>\n<li><strong>NOIX ET GRAINES\u00a0:<\/strong> amandes, noix de Grenoble et graines de s\u00e9same<\/li>\n<\/ul>\n<p><strong>Les aliments suivants n\u2019\u00e9taient pas disponibles dans l\u2019enqu\u00eate alimentaire\u00a0:<\/strong><\/p>\n<ul>\n<li>Graines de chia<\/li>\n<li>Graines de lin <\/div><strong>\u00a0<\/strong><\/li>\n<\/ul>\n<p><strong>OUTILS<\/strong><\/p>\n<ul>\n<li><a href=\"https:\/\/outilspoureclosions.ca\/tools\/binomial-probability-calculation-tool-for-food-exposures\/\">Outil de calcul de la probabilit\u00e9 binomiale de l\u2019exposition aux aliments<\/a><\/li>\n<\/ul>\n<p><a href=\"https:\/\/outilspoureclosions.ca\/case-study-overview\/module-2-hypothesis-generation-2\/exercise-1\/\">< Retour<\/a> <a href=\"https:\/\/outilspoureclosions.ca\/case-study-overview\/module-2-hypothesis-generation-2\/interpretation-of-hypothesis-generation-results\/\">Suivant ><\/a><\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"<p>\u00a0Jour\u00a022\u00a0: Vendredi 29 mai\u00a02020 (n\u00a0=\u00a014) Jusqu\u2019\u00e0 ce matin, vous avez effectu\u00e9 sept nouvelles entrevues au moyen du questionnaire g\u00e9n\u00e9rateur d\u2019hypoth\u00e8ses. Vous d\u00e9cidez d\u2019entrer vos questionnaires dans une base de donn\u00e9es puis d\u2019exporter les donn\u00e9es dans Microsoft Excel pour en faire l\u2019analyse. Vous devez analyser les donn\u00e9es pour d\u00e9terminer la fr\u00e9quence des expositions des cas et [&hellip;]<\/p>\n","protected":false},"author":33,"featured_media":0,"parent":4097,"menu_order":0,"comment_status":"closed","ping_status":"closed","template":"","meta":{"footnotes":""},"class_list":["post-4170","page","type-page","status-publish","hentry"],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/outbreaktools.ca\/fr\/wp-json\/wp\/v2\/pages\/4170","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/outbreaktools.ca\/fr\/wp-json\/wp\/v2\/pages"}],"about":[{"href":"https:\/\/outbreaktools.ca\/fr\/wp-json\/wp\/v2\/types\/page"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/outbreaktools.ca\/fr\/wp-json\/wp\/v2\/users\/33"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/outbreaktools.ca\/fr\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=4170"}],"version-history":[{"count":14,"href":"https:\/\/outbreaktools.ca\/fr\/wp-json\/wp\/v2\/pages\/4170\/revisions"}],"predecessor-version":[{"id":5835,"href":"https:\/\/outbreaktools.ca\/fr\/wp-json\/wp\/v2\/pages\/4170\/revisions\/5835"}],"up":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/outbreaktools.ca\/fr\/wp-json\/wp\/v2\/pages\/4097"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/outbreaktools.ca\/fr\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=4170"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}